花呗已经还清但不能使用的原因可能是因为还款信息还未同步到系统中，需要等待系统更新。另外，可能还存在其他逾期未还的借款导致花呗被冻结，需要联系花呗客服解决。还有一种情况是可能因为账户异常或违规操作等原因导致花呗被冻结，此时也需要联系客服解决。建议用户先确认还款情况是否正常，如仍无法使用花呗，可通过支付宝客服或花呗官网进行咨询和解决。

还款信息未同步到系统中

如果用户刚刚还完花呗的欠款，系统可能需要一段时间才能同步还款信息。在此期间，用户可能无法使用花呗。建议用户等待1-2个工作日后再次尝试使用。

存在其他逾期未还的借款

如果用户有其他借款逾期未还，花呗可能会被冻结，无法使用。用户需要及时还清逾期借款并等待系统更新。如果确认已还清所有借款，可以联系花呗客服解决。

账户异常或违规操作

如果花呗账户存在异常或违规操作，花呗可能会被冻结。异常情况包括账户被盗、信息被篡改等，违规操作包括花呗分期后提前还款、在其他应用上借钱等。用户需要联系花呗客服进行解决。

支付宝账户异常

花呗与支付宝账户紧密相关，如果支付宝账户存在异常，花呗也可能会被冻结。例如，支付宝账户因为安全原因被锁定，或者支付宝账户需要进行身份验证等。用户需要先解决支付宝账户异常问题，再尝试使用花呗。

花呗提额失败

如果用户的花呗提额申请被拒绝，可能导致无法使用花呗。花呗提额通常需要用户提交相关资料进行审核，如果资料不全或审核未通过，花呗提额将无法成功。用户可以联系花呗客服咨询解决方法。

总之，如果花呗已还清但不能使用，建议用户先确认还款情况是否正常，如仍无法使用花呗，可通过支付宝客服或花呗官网进行咨询和解决。在使用花呗时，用户应当遵守花呗规定，合理使用借款功能，避免违规操作导致账户被冻结。